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蓝藻是藻类生物，又叫蓝绿藻;大多数蓝藻的细胞壁外面有胶质衣，因此又叫黏藻。在一些营养丰富的水体中，有些蓝藻常于夏季大量繁殖，并在水面形成一层蓝绿色而有腥臭味的浮沬，称为“水华”，大规模的蓝藻暴发， 称为“绿潮”〔和海洋发生的“赤潮”对应广绿潮引起水质恶化，严重时耗尽水中氧气而造成鱼类死亡。更为严重的是，蓝藻中有些种类(如微囊藻) 还会产生毒素MC，大约50%的绿潮中含有大量MC。 除了直接对鱼类、人畜产生毒害之外，也是肝癌的重要诱因。MC耐热，不易被沸水分解，但可被活性炭吸收，所以可以用活性炭净水器净化污染水源。

　　2007年4月底5月初，太湖梅梁湾提前大规模暴发了藻类水华，导致周围水域大面积水质恶化，严重影响了居民生活和城市生产。此次太湖梅梁湾大规模藻类水华于4月25日暴发，比往年提前近一个月。5月2日，梅梁湾所有测点的藻类叶绿素a含量全部超过40ug/L，其中鼋头渚三山水域藻类叶绿素a含量达到179 ug/L,藻类水华在梅梁湾全湾暴发。其原因是太湖水质恶化，上游湖荡保护不够，以及梅梁湾直湖港、武进港节制闸建设等。这些因素使太湖失去了笫一道天然保护屏障，直接导致入湖污染物总量升高，总体水域呈现富营养化态势;1 ——4月，太湖水温高于正常年份，尤其是4月25曰以后太湖水温一直维持在20.℃以上，为藻类生长提供了良好的温度条件; 而同期太湖水位相对较低，四个月平均水位为2.94m，比常年平均水位低5cm，单位水柱水体光强较大，再加上整个太湖水温相对较高，促进了藻类生长;1——4月偏南风风场显著高于往年的平均值，这使其他湖区的藻类易于向梅梁湾聚集，加上三四月份风速明显偏小，有利于微囊藻上浮形成水华。

　　2007年6月24日，因天气闷热，滇池蓝藻大量繁殖，在昆明滇池海埂一线的岸边，湖水如绿油漆一般。绿浪翻滚的湖水涌向岸边、带来一阵阵腥臭味道。滇池是云南九大高原湖泊中污染最严重的一个，水质降为劣Ⅵ类，每年夏天气温上升，加之富营养化严重，均要引起蓝藻暴发，造成严重污染。

　　2005年从7月的一小块到9月几乎覆盖全湖，南京玄武湖水面已被蓝藻占领，浓得像油漆一样的绿。此次大面积的蓝藻是玄武湖自1986年以来再次暴发。对玄武湖的检测发现，主要是磷、氮等有机物超标，湖水呈现严重富营养化状态。专家分析认为，导致蓝藻疯长的原因既有内在原因，也有外来原因。由于湖水富营养化严重，湖水水质偏碱性，湖水中磷、氮等营养物质偏高，非常适合蓝藻的生长。这是玄武湖本身的原因;7月以及后来的一段时间，由于气温髙，湖水水温比较高，加上玄武湖周边地区不断有排污口排放污水，加剧了湖水富营养化，给蓝藻的生长创造了条件。