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中国江河、湖泊、水库、池塘等内陆水域面积约20万km2，其中湖泊有 6.6万km2。青藏高原和西北干旱气候区多为咸水湖或半咸水湖，生物种类和数量都较少。淡水湖的而积近3万km2。北方的水库、塘坝和南方的池塘面积虽不很大，但数量很多，在防洪、灌溉、养殖和调节局地气候方面的作用不可忽视。

内陆淡水水域中蕴藏着丰宮的生物资源，包括各种水生棺物、水生动物和浮游生物，构成了复杂的食物网，对于维持水体生态平衡起着灭键的作用。内陆水域中 有鱼类800多种，以鲤科占优势。浮游生物有250多种，还有多种底栖动物。水生动物中还有扬子鳄、白鳍豚等珍稀动物。大型水生植物有70余种，其中不少具有食用、饲用或药用价值。

中国淡水生态系统的退化，主要淼现在水域面积的减少和水体的污染。由于水土流失淤积泥沙、水利工程失修、超量利用水资源和围湖造田，导致水域面积不 断减少。一些地区农村工业无序扩散发展导致工业污染日益加重，加上过量使用化肥、农药，造成水体富营养化和有毒有害物质的积累，使得不少水城无法作为饮用水源，有些水源成为没有生物的死水，甚至不能用于工业冷却和农业灌溉，对沿岸人民的健康也造成了极大烕胁。

对淡水生态系统的保护必须从维持水域面积和治理水环境两个方面着手，一方面要实行退田还湖和疏通河道；另一方面要整治污染源，同吋还要保护水生生物 资源。中国政府规定从2003年起，每年对长江中下游实行两个月的禁渔期，以保护鱼类资源。